南开大学计算机学科的研究工作始于1958年，是在实力雄厚的数学学科和物理学科的基础上发展起来的，是我国最早从事计算机研究与教学的院校之一。2013年为构建南开现代工学学科体系，根据学校学科发展规划，对信息技术科学学

院学科进行优化整合，分别组建计算机与控制工程学院和电子信息与光学工程学院。2018年7月，为服务国家重大战略需求，加快推进“双一流”建设，培养适应和引领时代发展的未来人才，南开大学拆分计算机与控制工程学院，成立计算机学院。